Поліклініка №2 утворена згідно рішення Хмельницької міської ради № 132 від 06.06.1991 року з метою надання багатопрофільної медичної допомоги у районі своєї діяльності, проведення широких профілактичних заходів по попередженню і зниженню захворюваності серед населення території обслуговування, надання кваліфікованої спеціалізованої медичної допомоги.

Поліклініка №2 надавала амбулаторну медичну допомогу дорослому та дитячому населенню. В 2008 році пройшло відокремлення дитячої поліклініки в штат Хмельницької міської дитячої поліклініки. З 10.01.2017 року внаслідок реформування в приміщенні Хмельницької міської поліклініки №2 знаходилось два заклади – Хмельницька міська поліклініка №2 та Хмельницький міський центр первинної медико-санітарної допомоги №2.

З 02.05.2019 року в зв’язку з реорганізацією створено Комунальне підприємство «Хмельницький міський лікувально-діагностичний центр» і поліклініка №2 є його підрозділом.